21世纪，随着人们生活水平的不断提高，人们对食品质量也提出了新的要求，“无公害”成为人们衡量食品和蔬菜质量安全的标准。因此，添加有机肥的绿色食品深受消费者欢迎。也为有机肥提供了广阔的发展空间。
养殖场产生的大量畜禽粪便用于生产绿色有机肥，有机肥还田种植有机农业。农业废弃物和农业果实喂给各种畜禽，形成天然绿色生态生物链，保持生态平衡，让我们重新找回农村生活。
那么经营小型有机肥加工厂需要哪些手续呢？
首先需要肥料注册证：生产生物有机肥，需要办理肥料注册证。很多肥料企业要生产微生物有机肥，那么生物有机肥需要办理肥料注册证吗？我当然知道。生物有机肥是微生物肥料的一种，其实施标准为NY884-2012生物有机肥。指标要求是：有效活菌数2亿/g，有机质含量40.0%，需办理微生物肥料注册证。这种肥料是农业部注册的，具体手续可以咨询地区肥料注册管理处(土壤肥料站)。
一般要求：
1.申请人应当是经工商行政管理部门正式注册的具有独立法人资格的化肥生产企业。并具备微生物肥料生产设备、实验室检测设施，能开展生物有机肥的生产和质量检验。国外和港澳台地区的化肥生产企业可通过其在中国的办事处或委托机构提出申请。
2.申请肥料登记，应当按照登记类型填写申请表并提供相关资料。申请人提供的登记材料应列出总目录，包括所有材料的标题、排列位置和页码。根据《肥料登记管理办法》，肥料注册有四种类型：
(一)需要进行田间示范试验和田间小区试验后试销的肥料产品
向工业和信息化部提交《可行性研究报告》副本进行项目审批环境保护部(环评)发改委(正式项目审批)
办理营业执照税务登记证组织机构代码证注册资本(银行开户)
1.成立公司，经营范围必须包括“有机肥”，应该是“精制有机肥”。办理公司要求的手续。可以看《公司法》。拿到营业执照后，要完善公司要求的所有手续，包括税务登记和企业代码证。
2.建厂。在肥料注册的申请过程中，相关人员会到工厂取样化验。工厂取样有两个目的，一个是看你的工厂是否达标，另一个是亲自取样测试你的产品是否达标。所以，你得提前建一个像样的工厂。
3.申请商标
。必须申请自己的的商标。这个比较麻烦，因为凡是你能够想到的前50个好听的词都已经被人家注册了商标，你的商标既要响亮，表现自己的品牌特征，又不能跟别人的重复。4、产品自检。自己反复试验，使自己的产品能够达到NY525-2012标准，就是氮磷钾总养分要≥5%，有机质≥45%，水分≤30%，这些是主要指标，还有PH值、重金属等多项指标，都要符合要求。
5、提出申请。有了公司营业执照、工厂、自己的商标后，就可以向省农业厅提出肥料登记申请了。现在很多省已经实行政务大厅办公制，在大厅受理之后就听他们的指挥了。后面他们要做的就是到你厂里取样。
6、领取肥料登记证。如果厂房和样品检测都合格，则由省农业厅办发肥料登记证。
在办理完所有开场的手续之后，就该选择合适的地址建厂，对于厂址选择总体原则为：远离居民区，选择下风口；因地制宜、紧凑布置，尽量利用废弃不用的土地：生活区与厂址分开，保持环境卫生。
1、地势、地形：肥料厂应修建在地势高燥、平坦，排水良好的地方，最低应高出当地历史洪水线以上。其地下水位应在3米以下，这样的地势可以避免雨季洪水的威胁。场地面积可根据管理方式、厂房（包括加工车间、发酵车间、原料库、成品库）布置等来确定，要求布局紧凑，合理。
2、水源、电源：作为一个能正常运行的肥料厂，水源和电源必须能够正常供应；发酵车间的水分调质和加工车间的造粒都需要有充足定时的水分供应。为满足生产加工要求，成套加工设备和部分单机还需要稳定的电源。
3、社会联系：社会联系是指肥料厂与周围社会的联系。如与居民区的联系，交通和电力的供应等。因此，肥料厂的选址必须遵守社会公共卫生标准，使肥料厂不致成为周围环境的污染源，同时也不受周围环境的污染。
建一个有机肥厂需要投资多少钱呢？如果投资一个年产一万吨的小型有机肥生产线大概需要22万—25万左右。这其中就包括：生产过程中需要建设防雨钢构大棚以保证发酵肥料或者成本肥料不被雨水淋湿；人工工资；有机肥原料、生物菌种这些，还有有机肥的折旧费、电费、杂项开支。开个有机肥小厂一般年产一万吨以下的有机肥生产线就可以，自动化程度高点产量大点的需要二十万到四五十万。比较合适个体化的生产线一般为年产5000吨小型有机肥生产线10万元左右，包含有机肥翻抛机，动物粪便粉碎机，输送机等设备，需要更好的可以增加铲车、卧式搅拌机，有机肥造粒机，筛分机、称重包装机等成套设备，需要30万元左右。
